MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1003

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013358	TAA	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738836
2	NC_013358	TGT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738836
3	NC_013358	CTG	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738836
4	NC_013358	TC	3	6	387	392	0 %	50 %	0 %	50 %	260738836
5	NC_013358	GT	3	6	393	398	0 %	50 %	50 %	0 %	260738836
6	NC_013358	CTTT	2	8	416	423	0 %	75 %	0 %	25 %	260738836
7	NC_013358	TTG	2	6	461	466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738836
8	NC_013358	TCC	2	6	500	505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260738836
9	NC_013358	TGG	2	6	521	526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260738836
10	NC_013358	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738836
11	NC_013358	CAGC	2	8	601	608	25 %	0 %	25 %	50 %	260738836
12	NC_013358	AGG	2	6	614	619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260738836
13	NC_013358	GCT	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738836
14	NC_013358	AAT	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738836
15	NC_013358	GCT	3	9	762	770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738836
16	NC_013358	CT	3	6	1010	1015	0 %	50 %	0 %	50 %	260738836
17	NC_013358	TCT	2	6	1080	1085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738836
18	NC_013358	TCA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738836
19	NC_013358	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738836
20	NC_013358	G	6	6	1157	1162	0 %	0 %	100 %	0 %	260738836
21	NC_013358	CTT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738836
22	NC_013358	TGA	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738836
23	NC_013358	ATG	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738836
24	NC_013358	ATA	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738836
25	NC_013358	GAAA	2	8	1355	1362	75 %	0 %	25 %	0 %	260738836
26	NC_013358	CAC	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738836
27	NC_013358	CT	3	6	1466	1471	0 %	50 %	0 %	50 %	260738836
28	NC_013358	AGC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738836
29	NC_013358	TGT	2	6	1591	1596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738837
30	NC_013358	ATT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738837
31	NC_013358	TTTG	2	8	1706	1713	0 %	75 %	25 %	0 %	260738837
32	NC_013358	AAGAA	2	10	1867	1876	80 %	0 %	20 %	0 %	260738837
33	NC_013358	TTG	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738838
34	NC_013358	GTTC	2	8	2004	2011	0 %	50 %	25 %	25 %	260738838
35	NC_013358	T	6	6	2033	2038	0 %	100 %	0 %	0 %	260738838
36	NC_013358	GAT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738838
37	NC_013358	AGA	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738838
38	NC_013358	T	6	6	2313	2318	0 %	100 %	0 %	0 %	260738839
39	NC_013358	TCAC	2	8	2375	2382	25 %	25 %	0 %	50 %	260738839
40	NC_013358	TTG	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738839
41	NC_013358	TCA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738839
42	NC_013358	T	7	7	2633	2639	0 %	100 %	0 %	0 %	260738840
43	NC_013358	ATG	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738840
44	NC_013358	GCT	3	9	2705	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738840
45	NC_013358	TAC	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738840
46	NC_013358	CAG	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738840
47	NC_013358	CTT	2	6	2766	2771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738840
48	NC_013358	TA	3	6	2787	2792	50 %	50 %	0 %	0 %	260738840
49	NC_013358	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738840
50	NC_013358	TAT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738840
51	NC_013358	AAT	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738840
52	NC_013358	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	260738840
53	NC_013358	TTGC	2	8	2907	2914	0 %	50 %	25 %	25 %	260738840
54	NC_013358	TAA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738840
55	NC_013358	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738841
56	NC_013358	ATTCT	2	10	3399	3408	20 %	60 %	0 %	20 %	260738841
57	NC_013358	TGA	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738841
58	NC_013358	T	6	6	3473	3478	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
59	NC_013358	TTG	2	6	3493	3498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738841
60	NC_013358	T	6	6	3536	3541	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
61	NC_013358	T	8	8	3687	3694	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
62	NC_013358	AGT	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738841
63	NC_013358	GTT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738841
64	NC_013358	CAA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738841
65	NC_013358	GCA	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738841
66	NC_013358	TAA	2	6	4056	4061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738841
67	NC_013358	AAC	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738841
68	NC_013358	TAA	2	6	4111	4116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738841
69	NC_013358	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
70	NC_013358	AT	3	6	4191	4196	50 %	50 %	0 %	0 %	260738841
71	NC_013358	TATAT	2	10	4204	4213	40 %	60 %	0 %	0 %	260738841
72	NC_013358	TAA	2	6	4224	4229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738841
73	NC_013358	GCTAG	2	10	4253	4262	20 %	20 %	40 %	20 %	260738841
74	NC_013358	ATT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738841

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.